L’Ognon est une rivière située dans l’est de la France en région Bourgogne-Franche-Comté, dans les départements de la Côte-d’Or, du Doubs, du Jura et de la Haute-Saône.
Il est un affluent gauche de la Saône et donc un sous-affluent du Rhône.
De 213,6 km de longueur, il prend sa source à Château-Lambert, sur le versant sud du massif des Vosges (à 904 mètres d’altitude), et s’écoule essentiellement dans le département de Haute-Saône, la seconde moitié de son cours servant de limite avec les départements voisins du Doubs puis du Jura. Ses derniers kilomètres sont en Côte-d’Or. Il se jette dans la Saône à Heuilley-sur-Saône, à une vingtaine de kilomètres au sud-ouest (en aval) de Gray (à 185 mètre d’altitude).
L’Ognon traverse neuf zones hydrographiques pour une superficie totale de 2 308 km. Ce bassin versant est constitué à 49,08 % de « territoires agricoles », à 46,56 % de « forêts et milieux semi-naturels », à 4,10 % de « territoires artificialisés », à 0,26 % de« surfaces en eau ».
L’Ognon a cinquante-trois tronçons affluents référencés dont les affluents notables sont :
- le Rahin, 50,5 km
- le Scey, 20,4 km (affluent : le Rognon 18,8 km)
- la Reigne, 5,9 km
- la Linotte, 17,5 km
- la Rèsie, 14,5 km
- La Buthiers, 13,1 km
L’Ognon présente les fluctuations saisonnières de débit assez importantes et typiques de l’est de la France, avec
des crues d’hiver portant le débit mensuel moyen entre 50 et 57,5 m3/s, de décembre à mars inclus (maximum en janvier), et des basses eaux d’été de la mi-juin à la fin septembre, avec une baisse du débit moyen mensuel allant jusqu’au niveau de 9,6 m3/s au mois d’août.